Genomica

Sviluppo di metodologie sperimentali e bioinformatiche per il sequenziamento e la comprensione funzionale dei genomi procariotici ed eucariotici

Questo ambito di ricerca studia i genomi dei procarioti e degli eucarioti con il fine ultimo di capirne architettura e dinamica. La genomica si estende allo studio dei trascritti espressi (trascrittomica) e alle modificazioni cromatiniche (epigenomica) per capire come il genoma assuma funzioni diverse in risposta a stimoli, in tessuti diversi o in condizioni patologiche. Fondamentali contesti di applicazione della genomica umana sono lo studio delle mutazioni legate al cancro, polimorfismi associati all’insorgere di patologie genetiche e l’insorgere di mutazioni in presenza di esposizioni esterne (tossicogenetica). Nell’ambito dei procarioti, le attività di ricerca dipartimentali si focalizzano sullo studio di patogeni umani, di specie poco studiate e in grado di produrre nuove molecole con applicazioni di interesse industriale.

Gruppi di ricerca

Persone

Federico Antoniciello

Dottorando

Giulia Babbi

Ricercatrice a tempo determinato tipo a) (junior)

parole chiave: Proteomica, Sviluppo di database, Annotazione di proteine, Relazione gene-malattia, Malattie rare, Apprendimento

Roberto Bernardoni

Ricercatore confermato

parole chiave: Modelli animali di meccanismi molecolari correlati a insorgenza e progressione di Neuroblastoma infantile, malattie

Renato Brandimarti

Ricercatore confermato

Marco Candela

Professore ordinario

parole chiave: Scienze dei microbioti, Metagenomica, Biotecnologie dei microbiomi, One Health, Sostenibilità, Ecologia microbica ed

Martina Cappelletti

Professoressa associata

parole chiave: Microbiologia molecolare, Biotecnologie microbiche, Genomica microbica, Omiche applicate alla microbiologia,

Giovanni Capranico

Professore ordinario

parole chiave: DNA topoisomerasi, R-loop e strutture non-B del DNA, RNA non-codificanti, Gene expression, Regolazione della

Emidio Capriotti

Professore associato

parole chiave: Analysis and interpretation of cancer genome., Genome interpretation and prediction of disease-related protein

Fabiola Ceroni

Ricercatrice a tempo determinato tipo a) (junior)

parole chiave: autismo, neurosviluppo, neuroscienze

Paolo Emidio Costantini

Assegnista di ricerca

Tutor didattico

Marco Fabbrini

Dottorando

parole chiave: Microbiome, Metagenomics, Microbiota

Fabrizio Ferrè

Professore associato

Giorgio Gallinella

Professore ordinario

parole chiave: Parvovirus B19, Interazione virus-cellula, Infezioni virali, Virus ricombinanti, Composti antivirali

Federico Manuel Giorgi

Professore associato

parole chiave: Bioinformatica, Trascrittomica, Reti Geniche, Biologia Vegetale, Biologia del Cancro, Genomica, Biostatistica

Davide Maestri

Dottorando

Assegnista di ricerca

Jessica Marinello

Professoressa associata

parole chiave: Topoisomerasi umane, R-loops, Strutture non B del DNA, G-quadruplex, Danno al DNA

Laura Menotti

Professoressa associata

parole chiave: vettori virali, viroterapia oncolitica del cancro, recettore HER2, recettori tumorali, reindirizzamento e

Daniele Mercatelli

Ricercatore a tempo determinato tipo a) (junior)

parole chiave: Bioinformatica, Trascrittomica, Reti Geniche, Genomica, Oncologia, Biostatistica, Radiomica

Giorgio Milazzo

Ricercatore a tempo determinato tipo b) (senior)

parole chiave: Genetica, Biologia Molecolare, Biologia del Cancro, Neuroblastoma

Marco Rinaldo Oggioni

Professore ordinario

parole chiave: patogenicita' batterica

Simone Rampelli

Ricercatore a tempo determinato tipo a) (junior)

parole chiave: Microbiome, Metagenomics, Microbiota, Microbial Evolution

Patrizia Romualdi

Professoressa associata confermata

parole chiave: espressione genica, neuropeptidi, peptidi oppioidi, neurodegenerazione, farmaci d'abuso

Davide Roncarati

Professore associato

Marco Russo

Assegnista di ricerca

Tutor didattico

parole chiave: Bioinformatics, DRIP-sequencng, RNA-sequencing, DNA secondary structures, G-quadrplexes, R-loop, Genome instability

Genomica

Gruppi di ricerca

Persone

Federico Antoniciello

Giulia Babbi

Roberto Bernardoni

Renato Brandimarti

Marco Candela

Martina Cappelletti

Giovanni Capranico

Emidio Capriotti

Fabiola Ceroni

Paolo Emidio Costantini

Marco Fabbrini

Fabrizio Ferrè

Giorgio Gallinella

Federico Manuel Giorgi

Davide Maestri

Jessica Marinello

Laura Menotti

Daniele Mercatelli

Giorgio Milazzo

Marco Rinaldo Oggioni

Simone Rampelli

Patrizia Romualdi

Davide Roncarati

Marco Russo

Vincenzo Scarlato

Roberto Tonelli

Maria Paola Turina

Silvia Turroni

Suleman Khan Zadran