Genetica Microbica delle Infezioni. Coordinatore: Oggioni

La mission del Gruppo di Ricerca “Genetica Microbica delle Infezioni” è di identificare i meccanismi molecolari alla base della pato-fisiologia di interazione tra batteri ed ospite umano, nonché di sviluppare approcci traslazionali intesi a sfruttare queste conoscenze per prevenzione e trattamento.

Ricostruzione 3D di un immagine al microscopio confocale di un macrofago tissutale della milza umana che ha fagocitato il batterio Streptococcus pneumoniae. L’immagine è stata fatta su biopsie durante perfusione ex vivo di una milza. Blu nuclei, rosso marker macrofagico CD169, verde batteri.

Temi di ricerca del gruppo

  • Infezione: I primi eventi durante un’infezione sono rappresentati dall’incontro di batteri e virus con le difese immunitarie innate ed acquisite e solo eccezionalmente avvengono eventi specifici che permettano l’insorgenza di un’infezione localizzata o sistemica. Abbiamo recentemente scoperto che uno di questi meccanismi è rappresentato dalla replicazione di certi batteri all’interno di macrofagi tissutali nella milza (Ercoli 2018) e nel fegato (Wanford 2021) (vedi 3D di cellula infetta). I nostri dati mostrano come la conoscenza dei dettagli molecolari e cellulari di queste interazioni porterà nuove opportunità nella prevenzione e terapia delle malattie infettive (Carreno 2021).
  • Epigenetica Microbica: Lo studio delle dinamiche di popolazioni batteriche durante colonizzazione ed infezione dell’ospite ci ha portato a scoprire un processo di variazione di fase rapido che tramite modificazioni epigenetiche cambia espressione genica dei batteri (Manso 2014). Questo sistema phase-variabile di metilazione è presente in molte specie batteriche (De Ste Croix 2017) e rappresenta un nuovo modello per lo studio dei meccanismi molecolari di regolazione epigenetica nei procarioti.

Membri del Laboratorio  

  • Marco R. Oggioni, Professore Ordinario (BIO/19), Medico Microbiologo, responsabile della linea di ricerca su Infezioni ed Epigenetica.
  • Daniele Ghezzi, RTDa (BIO/19). Progetto PNRR INF-ACT su infezioni microbiche.
  • Claudia Trappetti, Assegnista di ricerca. Vaccino ad RNA contro pneumococco.
  • Francesco Flandi, Dottorando. Dottorato Biologia Cellulare e Molecolare, UniBo. Progetto PRIN su infezioni microbiche.
  • Giulia Cattabriga, Dottoranda. Dottorato Nazionale di Innovazione nella diagnosi, prevenzione e terapia delle infezioni a rischio epidemico-pandemico. Progetto su modelli di infezione traslazionali.

 

Posizioni disponibili 

  • Progetti di tesi di laurea specialistica su tutti i temi di ricerca
  • Assegno di Ricerca scadenza primavera 2024 con industria farmaceutica GSK
  • Assegno di Ricerca scadenza Giugno 2024 su vaccini per Pseudomonas

Pubblicazioni significative

    • Wanford JJ, Hames RG, Carreno D, Jasiunaite Z, Chung WY, Arena F, Di Pilato V, Straatman K, West K, Farzand R, Pizza M, Martinez-Pomares L, Andrew PW, Moxon ER, Dennison AR, Rossolini GM, Oggioni MR. Interaction of Klebsiella pneumoniae with tissue macrophages in a mouse infection model and ex-vivo pig organ perfusions: an exploratory investigation. Lancet Microbe. 2021 Dec;2(12):e695-e703. https://doi.org/ 1016/S2666-5247(21)00195-6
    • Carreno D, JJ Wanford, Z Jasiunaite, RG. Hames, WY Chung, AR. Dennison, K Straatman, L Martinez-Pomares, M Pareek, CJ Orihuela, MI Restrepo, WS Lim, PW Andrew, ER Moxon, MR Oggioni. 2021. Splenic macrophages as the source of bacteraemia during pneumococcal pneumonia. EBioMedicine. 2021 Oct 4;72:103601. https://doi.org/10.1016/j.ebiom.2021.103601
    • Manso AS, MH Chai, JM Atack, L Furi, M De Ste Croix, R Haigh, C Trappetti, AD Ogunniyi, LK Shewell, M Boitano, TA Clark, J Korlach, M Blades, E Mirkes, AN Gorban, JC Paton, MP Jennings, MR Oggioni. 2014. A random six-phase switch regulates pneumococcal virulence via global epigenetic changes. Nature Commun. 5:5055 https://doi.org/10.1038/ncomms6055
    • Ghezzi D, Boi M, Sassoni E, Valle F, Giusto E, Boanini E, Baldini N, Cappelletti M, Graziani G. Customized biofilm device for antibiofilm and antibacterial screening of newly developed nanostructured silver and zinc coatings. J Biol Eng. 2023 Mar 6;17(1):18. doi: 10.1186/s13036-023-00326-y.
    • Ercoli G, VE Fernandes, WY Chung, JJ Wanford, S Thomson, CD Bayliss, K Straatman, PR Crocker, A Dennison, L Martinez-Pomares, PW Andrew, ER Moxon, MR Oggioni. 2018. Intracellular replication of Streptococcus pneumoniae inside splenic macrophages serves as a reservoir for septicaemia. Nature Microbiology. 2018 May;3(5):600-610. doi: 10.1038/s41564-018-0147-1.

     

     

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