Biologia molecolare e genetica applicata. Coordinatore: Ambrosetti

Studio di fattori di trascrizione e retrotrasposoni nella regolazione dell’espressione genica

Temi di ricerca del gruppo

Il nostro gruppo è interessato alla caratterizzazione dei meccanismi molecolari che regolano la trascrizione nelle cellule eucariotiche.

1) Analizziamo i fattori di trascrizione della famiglia SOX ed il loro ruolo nella determinazione e differenziamento delle diverse linee cellulari che danno origine alla cresta neurale (melanociti, condrociti, osteoblasti e cellule gliali). Siamo inoltre interessati a capire come l’espressione anomala di alcuni fattori di trascrizione possa essere importante nella formazione e/o nella metastatizzazione di alcuni tumori (osteosarcomi, melanomi, carcinomi polmonari).

2) Studiamo il meccanismo di retrotrasposizione degli elementi LINE-1 nella risposta cellulare fisiologica e patologica. In particolare analizziamo vari stadi del processo di retrotrasposizione (trascrizione, metilazione del promotore, inserzione) in linee cellulari umane sottoposte a condizioni di stress.

Progetti di internato

-Clonaggio di gRNA per CRISP/Cas9 in cellule di carcinoma del polmone

-Ruolo di Sox 5 nella metastatizzazione del melanoma

-Analisi dell’espressione e dell’ attività di retrotrasposizione degli elementi LINE-1 in colture cellulari soggette a trattamenti con agenti fisici o chimici.

Pubblicazioni significative

Sancisi, V., Gandolfi, G., Ambrosetti, D.C., Ciarrocchi, A. (2015) Histone deacetylase inhibitors repress tumoral expression of the proinvasive factor RUNX2. Cancer Res.75(9):1868-1882. doi: 10.1158/0008-5472.CAN-14-2087 PDF

Ambrosetti, D., Holmes, G., Mansukhani, A., Basilico, C. (2008) Fibroblast growth factor signaling uses multiple mechanisms to inhibit Wnt-induced transcription in osteoblasts. Mol. Cell Biol. 28(15):4759-4771. doi: 10.1128/MCB.01849-07 PDF

Giorgi, G., Pirazzini, C., Bacalini, M.G., Giuliani, C., Garagnan,i P., Capri, M., Bersani, F., Del Re, B. (2017) Assessing the combined effect of extremely low-frequency magnetic field exposure and oxidative stress on LINE-1 promoter methylation in human neural cells Radiat Environ Biophys 56:193-200. doi:10.1007/s00411-017-0683-8

Giorgi, G., Marcantonio, P., Del Re, B. (2011) LINE-1 retrotransposition in human neuroblastoma cells is affected by oxidative stress. Cell Tissue Res. 346 :383-391. doi:10.1007/s00441-011-1289-0

Del Re, B., Marcantonio, P., Capri, M., Giorgi, G.(2010) Evaluation of LINE-1 mobility in neuroblastoma cells by in vitro retrotransposition reporter assay: FACS analysis can detect only the tip of the iceberg of the inserted L1 elements. Exp Cell Res. 316: 3358-3367 doi:10.1016/j.yexcr.2010.06.024

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