Genomica Funzionale ed Epigenetica. Coordinatore: Perini

Temi di ricerca del gruppo

Il gruppo si occupa di genetica del cancro ed in particolare dei meccanismi molecolari ed epigenetici che riguardano l’insorgenza e la progressione di particolari tumori pediatrici quali il neuroblastoma, il medulloblastoma e il retinoblastoma. Recentemente il gruppo ha iniziato ad occuparsi di malattie genetiche del muscolo scheletrico e del muscolo cardiaco e del possibile utilizzo dell’editing genomico per la cura di queste malattie. Gli studi sono condotti utilizzando numerose metodologie molecolari che vanno dalla manipolazione degli acidi nucleici e dei genomi in vitro (vettori di clonaggio ed espressione eucariotici) ed in vivo (CRISPR/CAS9) ad approcci genome-wide per lo studio dei trascrittomi (RNA-seq) e delle modificazioni epigenetiche a carico del DNA (metiloma) e della componente proteica della cromatina (modificazioni istoniche, ChIP-seq) nonché alla possibilità di ricapitolare in vitro specifiche interazioni DNA/proteina e proteina/proteina attraverso tecniche quali Co-IP, PLA (Proximal Ligation Assay), BiFC (Bimolecular Fluorescence Complementation) GST Pull down e EMSA. Gli studi si avvalgono sostanzialmente di modelli cellulari ottenuti da tumori primari, dell’utilizzo di cellule iPSCs da pazienti e dalla modellizzazione di alcuni meccanismi in Drosophila melanogaster e Mus musculus.

Membri del Laboratorio

Giovanni Perini, Professore Ordinario

Roberto Bernardoni, Ricercatore 

Giorgio Milazzo,  RTDb (scrivi)

Francesco Chemello, Professore Associato

Alberto Rigamonti, Dottorando

Sara Aloisi, Dottoranda

Suleman Khan Zadran, Assegnista di ricerca

Martina Santulli, Dottoranda

Elisa Dell'Anna, Dottoranda

Leonardo Cimadom, Dottorando

Progetti di internato

Progetti d’internato per Laurea magistrale

• Caratterizzazione funzionale del complesso MYCN/E2F3 in neuroblastoma e identificazione dei fattori di modificazione della cromatina che controllano la formazione del complesso
• Caratterizzazione funzionale del gene PRDM12 in Colon carcinoma
• Studio e ottimizzazione di nuove metodologie di drug delivery in cancer
• Caratterizzazione di nuovi complessi HDAC in neuroblastoma
• Utilizzo di tecnologie di genome editing per la correzione di mutazioni che causano la distrofia muscolare di Duchenne

Pubblicazioni significative

Wong M, Tee AEL, Milazzo G, Bell JL, Poulos RC, Atmadibrata B, Sun Y, Jing D, Ho N, Ling D, Liu PY, Zhang XD, Hüttelmaier S, Wong JWH, Wang J, Polly P, Perini G, Scarlett CJ, Liu T. The Histone Methyltransferase DOT1L Promotes Neuroblastoma by Regulating Gene Transcription. Cancer Res. 2017 May 1;77(9):2522-2533. doi: 10.1158/0008-5472.

Perini G, Milazzo G, Narayan N, Ekert PG. Letting the breaks off MYCN. Cell Death Differ. 2016 Dec;23(12):1904-1905. doi: 10.1038/cdd.2016.112.

Giordani G, Barraco M, Giangrande A, Martinelli G, Guadagnuolo V, Simonetti G, Perini G, Bernardoni R. The human Smoothened inhibitor PF-04449913 induces exit from quiescence and loss of multipotent Drosophila hematopoietic progenitor cells. Oncotarget. 2016 Aug 23;7(34):55313-55327. doi: 10.18632/oncotarget.10879

Amente S, Milazzo G, Sorrentino MC, Ambrosio S, Di Palo G, Lania L, Perini G, Majello B. Lysine-specific demethylase (LSD1/KDM1A) and MYCN cooperatively repress tumor suppressor genes in neuroblastoma. Oncotarget. 2015 Jun 10;6(16):14572-83

Liu PY, Erriquez D, Marshall GM, Tee AE, Polly P, Wong M, Liu B, Bell JL, Zhang XD, Milazzo G, Cheung BB, Fox A, Swarbrick A, Hüttelmaier S, Kavallaris M, Perini G, Mattick JS, Dinger ME, Liu T. Effects of a novel long noncoding RNA, lncUSMycN, on N-Myc expression and neuroblastoma progression. J Natl Cancer Inst. 2014 Jun 6;106(7). doi: 10.1093/jnci/dju113