Analisi bio-farmaceutica e farmaceutica. Coordinatrice: Bartolini

Temi di ricerca del gruppo

Temi bio-farmaceutici

Studio dei fenomeni di bio-riconoscimento molecolare e determinazione dei parametri cinetici e termodinamici di legame (k_on, k_off, K_D) mediante biosensore ottico a risonanza plasmonica di superficie (SPR), dicroismo circolare (CD) e fluorescenza.

Caratterizzazione di modifiche strutturali a carico di proteine d’interesse farmaceutico mediante cromatografia liquida accoppiata a spettrometria di massa (LC-MS) e analisi CD.

Sviluppo di sistemi a base di enzimi e proteine immobilizzati per studi in linea (inibizione, binding, digestione triptica e N-deglicosilazione).

Aree d’interesse:

Caratterizzazione di modifiche strutturali proteiche mediante cromatografia liquida accoppiata alla spettrometria di massa (LC–MS), con particolare riferimento a proteine coinvolte come biomarcatori di patologie associate a stress ossidativo e processi infiammatori.

Screening e caratterizzazione di inibitori reversibili e irreversibili per il trattamento della malattia di Alzheimer e di altre patologie neuroinfiammatorie, con focus su target molecolari quali enzimi colinesterasici, processi di aggregazione di β-amiloide e tau, e catepsine.

 Studio dei processi di bioriconoscimento e dei meccanismi di azione di nuovi composti diretti verso target epigenetici implicati nello sviluppo e nella progressione del carcinoma colorettale.

 Analisi della struttura secondaria di proteine e oligonucleotidi mediante dicroismo circolare, finalizzata alla correlazione tra conformazione molecolare, stabilità strutturale e funzione biologica.

Temi farmaceutici

Sviluppo e convalida di nuovi metodi HPLC per il controllo qualità di preparazioni farmaceutiche e di nutraceutici (integratori alimentari e dietetici) sia di nuova formulazione che commerciali, contenenti principi attivi di origine sintetica e/o naturale, al fine di renderne disponibile l'applicazione a livello aziendale.

Il gruppo partecipa ai seguenti progetti PNRR:

• Partenariato Esteso Mnesys PNRR NextGenerationEU

Spoke N.7 - PNRR PE12 -MNESYS A multiscale integrated approach to the study of the nervous system in health and disease

• RNA and Gene Therapy. National Research Center, PNRR NextGenerationEU

PNRR mRNA National Center for Gene Therapy and Drugs based on RNA Technology, PNRR CN MRNA- Spoke N.2- Cancer

Membri del Laboratorio

Manuela Bartolini,   Professoressa Ordinaria

Marina Naldi, Professoressa Associata 

Wendy Appiagyei Mensah, Dottoranda

Rosaria Spagnuolo, Dottoranda

Viviana Mitarotonda, Dottoranda (in co-tutela con la Dott.ssa Uliassi)

Sara Ventura, Dottoranda 

Irene Castellino, Dottoranda Marie Skłodowska-Curie Action - MSCA

Kazi Ishrak Faiyaz, Dottorando Marie Skłodowska-Curie Action - MSCA

Progetti di internato

Internati per studenti dei CdS in CTF, Biotecnologie, Scienze Farmaceutiche Applicate e Pharmaceutical Biotechnology.

Gli argomenti delle tesi recentemente discusse sono reperibili sui siti dei membri del gruppo.

Pubblicazioni significative

• M.D. Parenti, M. Naldi, E. Manoni, E. Fabini, D. Cederfelt, V.O. Talibov, V. Gressani, U. Guven, V. Grossi, C. Fasano, P. Sanese, K. De Marco, A.A. Shtil, A.V. Kurkin, A. Altieri, U.H. Danielson, G. Caretti, C. Simone, G. Varchi, M. Bartolini, A. Del Rio. Discovery of the 4-aminopiperidine-based compound EM127 for the site-specific covalent inhibition of SMYD3. Eur J Med Chem. 2022, 243, 114683. doi: 10.1016/j.ejmech.2022.114683. 
• A Tramarin, M Naldi, G Degani, L Lupu, P Wiegand, A Mazzolari, A Altomare, G Aldini, L Popolo, G Vistoli, M Przybylski, M Bartolini. Unveiling the molecular mechanisms underpinning biorecognition of early-glycated human serum albumin and receptor for advanced glycation end products. Analytical and Bioanalytical Chemistry, 2020, 412, 4245. DOI: 10.1007/s00216-020-02674-w
• M Naldi, U Černigoj, A Štrancar, M Bartolini. Towards automation in protein digestion: Development of a monolithic trypsin immobilized reactor for highly efficient on-line digestion and analysis. Talanta 2017, 167, 143. DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.talanta.2017.02.016 
• X Zha, D Lamba, L Zhang, Y Lou, C Xu, D Kang, L Chen, Y Xu, L Zhang, A De Simone, S Samez, A Pesaresi, J Stojan, MG Lopez, J Egea, V Andrisano, M Bartolini. Novel tacrine-benzofuran hybrids as potent multitarget-directed ligands for the treatment of Alzheimer’s disease: design, synthesis, biological evaluation, and X-ray crystallography. J Med Chem 2016, 59, 114. DOI:10.1021/acs.jmedchem.5b01119
• M Bartolini, C Bertucci, ML Bolognesi, A Cavalli, C Melchiorre, V Andrisano. Insight into the kinetic of amyloid b(1–42) peptide self-aggregation: elucidation of inhibitors’ mechanism of action. ChemBioChem 2007, 8, 2152. DOI: 10.1002/cbic.200700427