Chimica Farmaceutica Computazionale. Coordinatore: Recanatini

La nostra ricerca è incentrata sull’applicazione e lo sviluppo di diversi strumenti in silico, principalmente basati su chimica/biologia computazionale e network science, con l’obiettivo di razionalizzare e predire proprietà e caratteristiche di sistemi molecolari di interesse farmaceutico

Temi di ricerca del gruppo

- Applicazione e sviluppo di metodi simulativi basati sulla Dinamica Molecolare: il nostro gruppo di ricerca ha una consolidata esperienza nell’utilizzo di metodi simulativi avanzati, sia atomistici che multiscala, e di campionamento accelerato.

- Studi di Docking e Virtual-Screening: il nostro gruppo di ricerca impiega routinariamente metodi di Docking e Virtual Screening per accelerare il processo di identificazione e sviluppo di molecole bioattive.

- Analisi di reti di interazioni per lo studio e l’identificazione di nuovi target e nuovi composti biologicamente attivi: una nuova linea di ricerca è focalizzata sull’uso della Scienza delle Reti (Network Science) per la predizione di associazioni ligando-target e lo studio di sistemi target.

Membri del Laboratorio

Maurizio Recanatini. Scrivi a Maurizio Recanatini, o visita la sua pagina

Andrea Cavalli. Scrivi a Andrea Cavalli, o visita la sua pagina

Matteo Masetti. Scrivi a Matteo Masetti, o visita la sua pagina

Riccardo Ocello. Scrivi a Riccardo Ocello

Federico Falchi

Chiara Cabrelle

Luca Menestrina

Stefano Bosio

Progetti di internato

Due per anno.

Pubblicazioni significative 

  • Menestrina L, Cabrelle C, Recanatini M. (2021) "COVIDrugNet: a network-based web tool to investigate the drugs currently in clinical trial to contrast COVID-19." Sci Rep. 11:19426. doi: 10.1038/s41598-021-98812-0
  • Ocello R, Furini S, Lugli F, Recanatini M, Domene C, Masetti M. (2020) "Conduction and Gating Properties of the TRAAK Channel from Molecular Dynamics Simulations with Different Force Fields." J Chem Inf Model. 60:6532-6543. doi: 10.1021/acs.jcim.0c01179 
  • Recanatini M, Cabrelle C. (2020) "Drug Research Meets Network Science: Where Are We?" J Med Chem. 63:8653-8666. doi: 10.1021/acs.jmedchem.9b01989
  • Bernetti M, Masetti M, Recanatini M, Amaro RE, Cavalli A. (2020) "An Integrated Markov State Model and Path Metadynamics Approach To Characterize Drug Binding Processes." J Chem Theory Comput. 15:5689-5702. doi: 10.1021/acs.jctc.9b00450
  • Masetti M, Berti C, Ocello R, Di Martino GP, Recanatini M, Fiegna C, Cavalli A. (2016) "Multiscale Simulations of a Two-Pore Potassium Channel." J Chem Theory Comput. 12:5681-5687. doi: 10.1021/acs.jctc.6b00972

 

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