Chimica Farmaceutica Computazionale. Coordinatore: Masetti

Esempio di un sistema studiato attraverso simulazioni molecolari

Temi di ricerca del gruppo

- Studi di Docking e Virtual Screening: il nostro gruppo di ricerca impiega routinariamente metodi di Docking e Virtual Screening per accelerare il processo di identificazione e sviluppo di molecole bioattive.

- Applicazione e sviluppo di metodi basati sulle simulazioni di dinamica molecolare: il nostro gruppo di ricerca ha una consolidata esperienza nell’utilizzo di metodi simulativi avanzati, sia atomistici che multiscala e di campionamento accelerato.

Membri del Laboratorio

Matteo Masetti, Professore Associato

Andrea Cavalli, Professore Ordinario (in aspettativa)

Federico Falchi, Professore Associato

Progetti di internato

2/3 per anno

Pubblicazioni significative

• Bresciani, V.; Rinaldi, F.; Franco, P.; Girotto, S.; Cavalli, A.; Langer, J. D.; Masetti, M.; Bernetti, M. (2025). “Dissecting the RAD51-BRC4 Interaction Landscape through Integrative Molecular Simulations and Experimental Biophysics.” Chem. Inf. Model. 65: 11965-11978. https://doi.org/10.1021/acs.jcim.5c01639.
• Marotta, G.; Massenzio, F.; Ortega, J.; Russo, D.; Penna, I.; Falchi, F.; Babini, G.; Petralla, S.; Scarpelli, R.; Roggiolani, E.; Fricker, G.; Rosini, M.; Cavalli, A.; Monti, B.; Minarini, A.; Basagni, F. (2025) “Exploration of the Neuromodulatory Properties of Fyn and GSK-3β Kinases Exploiting 7-Azaindole-Based Inhibitors.” J. Med. Chem. 68: 17130-17154. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.5c00629.
• Romeo, E.; Saccoliti, F.; Ocello, R.; Andonaia, A.; Allegretta, C.; Pastorino, C.; Pedemonte, N.; Falchi, F.; Laselva, O.; Bandiera, T.; Bertozzi, F. (2025) “Target Identification with Live-Cell Photoaffinity Labeling and Mechanism of Action Elucidation of ARN23765, a Highly Potent CFTR Corrector” J. Med. Chem. 68: 4596-4618. https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.4c02654.
• Masi, M.; Poppi, L.; Previtali, V.; Nelson, S. R.; Wynne, K.; Varignani, G.; Falchi, F.; Veronesi, M.; Albanesi, E.; Tedesco, D.; De Franco, F.; Ciamarone, A.; Myers, S. H.; Ortega, J. A.; Bagnolini, G.; Ferrandi, G.; Farabegoli, F.; Tirelli, N.; Di Stefano, G.; Oliviero, G.; Walsh, N.; Roberti, M.; Girotto, S.; Cavalli, A. (2025) “Investigating synthetic lethality and PARP inhibitor resistance in pancreatic cancer through enantiomer differential activity.” Cell Death Discov. 11: 106. https://doi.org/10.1038/s41420-025-02382-3.
• Domene, C.; Ocello, R.; Masetti, M.; Furini, S. (2021). "Ion conduction mechanisms as a fingerprint of potassium channels." Am. Chem. Soc. 143: 12181-12193. https://doi.org/10.1021/jacs.1c04802.